48チーム出場の令和3年度全国高校総体（インターハイ）沖縄予選の3回戦が5月20日に行われた。

　前回大会優勝で、第99回全国高校サッカー選手権沖縄予選を制した那覇西は3-2で普天間に勝利。令和2年度沖縄新人戦（新人選手権大会）覇者の那覇は北谷を2-0で退けた。地元開催だった2019年度大会に沖縄第2代表として全国の舞台を踏んだ西原は糸満をPK戦の末に下し次戦に駒を進めた。また、興南は与勝に2-0で、宜野湾は4-0で読谷を下している。なお、決勝は23日に行われる。